Šobrīd Eiropas Parlamenta deputātiem maksā valsts valdības tādā pašā veidā kā viņu kolēģiem valstu parlamentos. Arī nodokļus viņi maksā valsts līmenī.2003. gada 1. februārī Nicas līgums Padomē par Eiropas Parlamenta locekļu statūtu ieviesa kvalificētā vairākuma (qualified majority) balsojumu. Eiropas Parlaments strādā pie projekta noslēguma, kas Eiropas Parlamenta locekļiem piešķirs vienlīdzīgas darba algas 8000 eiroeiru mēnesī, ar pazeminātu Kopienas nodokli.Zviedrija, Dānija un, iespējams, Somija un Apvienotā Karaliste izmantos opt-out (izņēmumus), pieļaujot valsts papildu nodokļus, lai tādējādi Eiropas Parlamenta locekļu darba algas vēl vairāk tuvinātu valsts parlamenta locekļu darba algu līmenim.
Reforma nozīmētu zemāku darba algu tiem locekļiem, kuri ir no vislabāk maksājošajām valstīm, piemēram, Itālijas, Austrijas, Apvienotās Karalistes un Vācijas, taču lielākajai daļai locekļu darba alga palielinātos. Padome pieņems jauno darba algu sistēmu tikai gadījumā, ja Eiropas Parlaments novērsīs problēmas saistībā ar transporta ļaunprātīgu izmantošanu. Šobrīd Eiropas Parlamenta locekļiem tiek atmaksātas lidmašīnas biļetes pirmajā klasē vienu reizi nedēļā, lai tie varētu apmeklēt Parlamenta sanāksmes pat tad, ja viņi ceļo ekonomiskajā klasē.
NākotnePēc ierosinātās reformas Eiropas Parlamenta locekļiem tiks atmaksāti patiesie ceļošanas izdevumi, kā arī taksometra pakalpojumi nelielu attālumu veikšanai, ģimenes ceļošanai u. c.
